Η Κυπριακή Ομοσπονδία Θαλάσσιου Σκι ιδρύθηκε το 1987 και από τότε είναι μέλος της Παγκόσμιας Ομοσπονδίας Θαλάσσιου Σκι. Είναι εγκαταστημένη στη Λεμεσό και ο χώρος προπονήσεων/εκπαίδευσης της βρίσκεται έξω από το λιμάνι της Λεμεσού. Χρέη διευθυντικού σώματος ασκεί το Διοικητικό Συμβούλιο, αποτελούμενο από επτά άτομα που προτείνονται από τα σωματεία Θαλάσσιου Σκι - μέλη της Ομοσπονδίας. Η κύρια πηγή χρηματοδότησης είναι ο Κυπριακός Οργανισμός Αθλητισμού (ΚΟA) καθώς και άλλη οικονομική βοήθεια που παρέχεται -περιστασιακά -από διάφορους υποστηρικτές του αθλήματος.